Festyn 2012

31 maja 2012, MIM UW, godz. 15.00 - 19.00

Czego się spodziewać na festynie

Festyn Bioinformatyczny pomyślany został jako wydarzenie popularyzujące nie tylko bioinformatykę jako przedmiot studiów, ale też wyciągający z cienia ludzi, którzy na Uniwersytecie zajmują się tą młodą dziedziną. Ponadto chcemy aby odwiedzający Festyn nie tylko mieli okazję zobaczyć jakie badania prowadzą uniwersyteccy bioinformatycy. Chcemy także pokazać jak na ten obszar badań patrzą matematycy,a jak biolodzy. Oficjalna strona wydarzenia na Facebooku: http://www.facebook.com/events/102855449855158/.

Wykłady - wykłady odbywają się w sali 3180 15:00

• Rozpoczęcie 15:10 - 15:40 prof. Paweł Golik (Wydział Biologii UW) opowie o skrzyżowaniu genetyki i bioinformatyki na tropie ewolucji mitochondriów
• 15:45 - 16:15 dr Anna Muszewska (Centrum Nowych Technologii UW) zdradzi jak bada się horyzontalny transfer genów i co z tego wynika
• 16:20 - 16.50 dr Paweł Górecki (Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki UW) przedstawi podstawy modelu drzew uzgadniających i jego zastosowania w badaniu ewolucji genów
• 16:50 - 17:00 Przerwa
• 17:00 - 17:30 dr Paweł Siedlecki (Wydział Biologii UW) pokaże jak bioinformatyk projektuje skuteczne leki
• 17:35 - 18:05 dr Przemysław Biecek (Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki UW) opowie o dobrych i złych wizualizacjach danych oraz o tworzeniu sensu z obrazków
• 18:10 - 18.40 prof. Andrzej Jerzmanowski (Wydział Biologii UW) podzieli się refleksjami na temat skrzyżowania biologii i matematyki
• 18:40 - 19:00 Podsumowanie i zakończenie

Warsztaty

Warsztaty z modelowania białek zaczną się o godz. 15.40 i potrwają około godziny. Wiedza wymagana: znajomość różnic DNA/białko. Umiejętności wymagane: sprawne obsługiwanie myszy, klawiatury i przeglądarki internetowej. Resztę pokażemy na miejscu :). Ilość stanowisk: 15. W przypadku dużego zainteresowania mozliwa jest praca w parach.

Turniej

Foldit jest przykładem gry dzięki której “zwykli śmiertelnicy” mogą przyczynić się do rozwoju nauki. W tym przypadku pomoc polega na rozwiązywaniu nieznanych, trójwymiarowych struktur białek. Przed turniejem odbędzie się wstęp teoretyczny przybliżający problemy struktury oraz zwijania białek. Następnie chętne osoby pod okiem studentów bioinformatyki będą mogły nauczyć się podstaw gry aby móc wziąć udział w turnieju. Mamy nadzieję, że zacięta rywalizacja pozwoli na spektakularny sukces w zwijaniu białek! A nawet jeśli nie.. to dla najlepszych przygotowane są nagrody :) Grę można ściągnąć tutaj.

Gry

Porównywanie genomów fagów Fagi, czyli wirusy atakujące bakterie, maja bardzo kompaktowy genom (zawiera małą liczbę genów i osadzone są one tuz obok siebie). Uczestnicy Festynu będą mieli za zadanie porównać genomy kilku fagów, które pocięte na geny (w postaci papierowych strzałek) zostana pomieszane w pudełku. Złożenie tej mozaiki wymagało będzie użycia najbardziej popularnego narzędzia bioinformatycznego - programu BLAST. Wróżka bioinformatyczna Będzie możliwośc powróżenia z imienia, a mówiąc bardziej precyzyjnie, sprawdzenia w jakich białkach znajduje się słowo/słowa najbardziej podobne do imienia uczestników. Craig Venter w genomie pierwszego całkowicie systetycznego organizmu zakodował swoje imię i nazwisko. Kto wie, może ewolucja zrobiła podobny prezent przysłowiowemu Janowi Kowalskiemu? Twister microRNA Złożone organizmy używają wielu różnych sposobów do precyzyjnej kontroli procesów zachodzących na poziomie molekularnym. Jednym z nich jest użycie krótkich fragmentów RNA, zwanych microRNA. Uczestnicy będą mieli okazję dogłębnego zapoznania się z ich funkcją oraz do kontemplacji piękna idei regulacji przez microRNA podczas próby odtworzenia swoim ciałem wylosowanej sekwencji ludzkiego microRNA. Dla tych, którym ta sztuka się uda, przewidujemy upominki. Budujemy DNA Z wiedzy szkolnej więkoszość z nas pamięta, że DNA składa się z sześciu podstawowych składników - cukru, reszty forsforanowej oraz czterech zasad - adeniny, guaniny, cytozyny oraz tyminy. Wykorzystując tę wiedzę spróbujemy za pomocą drutu i koralików zbudować prosty model DNA.